Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mkrn3Q60764 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms