Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms