Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms