Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms