Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zdbf2Q5SS00 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zdbf2Q5SS00 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms