Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trdv2-2Q5R1A4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trdv2-2Q5R1A4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms