Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Trappc1Q5NCF2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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