Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SynaQ5G5D5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms