Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prkaa1Q5EG47 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkaa1Q5EG47 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms