Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q5EBG8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q5EBG8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms