Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Spire1Q52KF3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spire1Q52KF3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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