Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnl1Q52KE7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms