Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM5

Miga1, Mitoguardin 1, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga1Q4QQM5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Miga1Q4QQM5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Miga1Q4QQM5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Miga1Q4QQM5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Miga1Q4QQM5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Miga1Q4QQM5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms