Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc3lQ4KL14 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms