Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms