Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garnl3Q3V0G7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garnl3Q3V0G7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms