Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Znf48Q3US17 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms