Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms