Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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