Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc33Q3ULW6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms