Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms