Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b2Q3UJB0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms