Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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