Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndst1Q3UHN9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst1Q3UHN9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms