Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q3U6N9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Q3U6N9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Q3U6N9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Q3U6N9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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