Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U595 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U595 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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