Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ulk3Q3U3Q1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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