Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Rnf149Q3U2C5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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