Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LcorlQ3U285 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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