Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Serac1Q3U213 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Serac1Q3U213 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms