Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc9Q3U0M1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms