Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc136Q3TVA9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc136Q3TVA9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms