Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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