Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XylbQ3TNA1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms