Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms