Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam107bQ3TGF2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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