Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prr27Q3SYJ2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms