Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Colec11Q3SXB8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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