Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdss2Q33DR3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms