Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms