Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlrp1aQ2LKU9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlrp1aQ2LKU9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms