Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim71Q1PSW8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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