Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam171bQ14CH0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms