Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Tdrd9Q14BI7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Tdrd9Q14BI7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tdrd9Q14BI7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd9Q14BI7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms