Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Rpusd2Q149F1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpusd2Q149F1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms