Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms