Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rundc1Q0VDN7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms