Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Itgb8Q0VBD0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms