Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms