Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Calb2Q08331 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Calb2Q08331 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms